甘泉生产基地位于扬州市邗江区，占地面积125亩，建筑面积45000㎡，建有口服制剂楼、无菌制剂楼、综合仓库、质量检验中心、工程中心及配套污水处理设施，同时预留三栋生产楼，未来可满足十五个车间的生产。口服固体制剂车间采用国内一流的药品生产设备，建立了3条现代化的生产线，涉及片剂、胶囊、颗粒三大经典剂型，于2017年5月获得GMP证书并正式投产。车间设计年产能为片剂10亿片、胶囊剂5亿粒、颗粒剂5000万袋。

刘庄生产基地位于扬州市维扬经济开发区，占地面积50亩，为人源蛋白生产基地。

公司采用具有自主知识产权的尿蛋白在线富集专利技术，成功攻克了人源蛋白大规模提取和纯化的国际性技术难题，提取纯化出乌司他丁原料、尿激酶原料、人尿激肽原酶原料、尿抑胃肽（EGF）原料、高纯度人血白蛋白、β2-微球蛋白粗品等多种以尿液为来源的蛋白质产品。

吴桥生产基地，位于扬州市广陵区。2014年10月08日首次通过2010年版GMP认证,目前厂区建有番泻叶清膏提取车间和蜡样芽胞杆菌粉、蜡样芽孢杆菌片生产车间，以及相关配套设施设备。

扬州徐辉互联网营销学院有限公司医药生产基地位于扬州生物科技园，占地面积 67.5 亩，专注于医药中间体、原料药的研发、生产和销售，主要为公司提供高质量的原料药。目前正在建设创新药物中试放大研发中心及多条原料药生产线。